Karolinska Institutet má dva kampusy. Jeden se nachází v samotném centru Stockholmu a druhý na jižní okraji města. Nedaleko obou kampusů stojí fakultní nemocnice. Kampusy se skládaní z mnoha budov, kde najdeme velké prostory pro setkávání studentů a hlavně jsou skvělá pro učení. Dále má univerzita svou vlastní tělocvičnu, venkovní prostory určené třeba pro grilování. Nenajdeme v ní však menzu, ale prostory s mikrovlnkami a jídelními stoly.